职能不同：锦衣卫有巡察缉捕之权，从事侦察、逮捕、审问活动。东厂职能主要是要监督朝中大臣的举动;设立时间不同：朱元璋在1382年设立锦衣卫，朱棣在1420年设立东缉事厂(简称东厂)。 作为皇帝侍卫的军事机构，锦衣卫主要职能为“掌直驾侍卫、巡查缉捕”，从事侦察、逮捕、审问等活动。

职能划分 1、锦衣卫建立之初作为皇帝侍卫的军事机构，掌管刑狱，被赋予巡察缉捕之权，从事侦察、逮捕、审问活动。明成祖将锦衣卫重新恢复后，其职能和影响不断扩大，不但可以逮捕皇亲国戚和文武大臣，还介入军中，参与搜集军事情报、策反敌对将领等工作。 2、东厂的职能是“访谋逆妖言大奸恶等，与锦衣卫均权势”。明成祖想知道朝中大臣的一举一动，便由东厂来完成，同时也为了对锦衣卫的活动有所监督。

设立时间 1、明太祖朱元璋在明洪武十五年(1382年)设立锦衣卫，后被废除。明成祖朱棣在“靖难之役”登上了皇位，为了监视和打击朝中的反对政治力量，他又将锦衣卫重新恢复。 2、明成祖朱棣于永乐十八年(1420年)设立东缉事厂(简称东厂)，东厂是世界历史上最早设立的国家特务情报机关，其分支机构远达朝鲜半岛。

权利归属 1、锦衣卫成立时间最早，可是权利却被东厂后来居上。 2、由于东厂厂主与皇帝的关系密切，又身处皇宫大内，更容易得到皇帝的信任。东厂和锦衣卫的关系，逐渐由平级变成了上下级关系 。