首都医科大学2021在全国本科院校排名第85位，强于第86名的上海师范大学，第87名的深圳大学，第88名的河南大学，第89名的安徽大学，第90名的中国石油大学(华东)。在北京排第16名，强于第17名的北京协和医学院，第18名的中国政法大学，第19名的首都师范大学，第20名的北京林业大学，第21名的中国传媒大学。
| 竞争力排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2021 | 85 | 首都医科大学 | 北京 | 16 |
| 2020 | 78 | 首都医科大学 | 北京 | 15 |
| 2019 | 83 | 首都医科大学 | 北京 | 16 |
| 2018 | 81 | 首都医科大学 | 北京 | 16 |
| 2017 | 63 | 首都医科大学 | 北京 | 13 |
综合实力排名（校友会版）
在全国本科院校排名第105位，在北京排第22名。
| 校友会排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2020 | 105 | 首都医科大学 | 北京 | 22 |
| 2019 | 108 | 首都医科大学 | 北京 | 20 |
| 2018 | 100 | 首都医科大学 | 北京 | 20 |
| 2017 | 94 | 首都医科大学 | 北京 | 19 |
综合实力排名（软科版）
在全国本科院校排名第46位，在北京排第11名。
| 软科排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2018 | 46 | 首都医科大学 | 北京 | 11 |
| 2017 | 42 | 首都医科大学 | 北京 | 11 |
