福建双一流大学排名第一的是厦门大学，排名第二的是福州大学。

厦门大学

厦门大学（Xiamen University），简称厦大（XMU），于1921年创办，是中国近代教育史上第一所华侨创办的大学，是国内最早招收研究生的大学之一，中国首个在海外建设独立校园的大学，被誉为“南方之强”。

学校直属教育部，中央直管副部级建制，是综合性研究型全国重点大学。教育部、国家国防科技工业局、福建省和厦门市重点共建，是国家“双一流”世界一流大学建设高校，国家“2011计划”牵头高校，国家“211工程“和“985工程”重点建设高校，首批20所学位自主审核高校，入选111计划、珠峰计划、卓越工程师教育培养计划、卓越法律人才教育培养计划、卓越医生教育培养计划、国家级大学生创新创业训练计划、国家级新工科研究与实践项目、国家大学生创新性实验计划、国家建设高水平大学公派研究生项目、中国政府奖学金来华留学生接收院校、教育部来华留学示范基地、全国深化创新创业教育改革示范高校。

福州大学

福州大学是国家“双一流”建设高校、国家“211工程”重点建设大学、福建省人民政府与国家教育部共建高校。学校创建于1958年，现已发展成为一所以工为主、理工结合，理、工、经、管、文、法、艺等多学科协调发展的重点大学。

福建省三所重点建设的高水平大学之一，福建省一流大学建设高校，入选国家建设高水平大学公派研究生项目、教育部首批“卓越工程师教育培养计划”高校、新工科研究与实践项目、数据中国“百校工程”项目、“高校国际化示范学院推进计划”、国家级大学生创新创业训练计划、全国首批深化创新创业教育改革示范高校、中国政府奖学金来华留学生接收院校、全国专业学位研究生教育综合改革试点单位、国家集成电路人才培养基地、首批高等学校科技成果转化和技术转移基地。