异地就医备案后可能存在的缺点主要包括：

就诊医院限制：

备案后，参保人员只能在指定的2-3家异地定点医院进行就医，否则可能面临报销比例低或不报销的情况。

原参保地医保冻结：

异地备案生效后，原参保地的医保状态可能会发生变化，部分地区参保人异地安置备案生效后，原参保地的医保可能会被冻结。

备案生效后短期内不能变更：

办理异地安置手续后，参保人在短期内不能变更备案信息，这降低了备案的灵活性。

信息不对称问题：

在备案过程中，可能会出现信息不对称，比如医院未告知患者备案失败的原因，导致患者在解决问题时感到困惑。

费用不透明问题：

备案过程中，有些医院可能会以各种名义收取额外费用，如服务费或手续费，这些费用在医保政策中可能没有明确规定，增加了患者的经济负担。

备案流程复杂：

备案流程繁琐，需要提供多种证明材料，并且不同地区的备案手续可能不同，增加了患者的时间和精力消耗。

备案周期长：

备案周期通常需要几个工作日，实际操作中可能更长，这可能导致患者在等待备案过程中需要住院治疗，增加费用和恢复时间。

影响本地医保使用：

异地就医备案后，参保人在备案期间无法在本地使用医保，需要注销备案才能恢复本地医保使用。

以上缺点可能会对需要异地就医的患者造成不便，影响其医疗服务的可及性和质量