事业单位的社保扣缴方式如下：

单位和个人共同缴费

事业单位及其员工需要共同缴纳五险一金，其中养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险由单位和个人共同承担，而住房公积金也是强制性的，由单位和个人依法缴纳。

缴费比例

养老保险：单位缴纳20%，个人缴纳8%。

医疗保险：单位缴纳8%，个人缴纳2%外加10块钱的大病统筹。

失业保险：单位缴纳2%，个人缴纳1%。

工伤保险：单位根据行业风险确定比例，通常在0.5%至2%之间。

生育保险：单位全额缴纳，比例为职工个人年度月平均工资的0.8%。

缴费基数

缴费基数通常为职工工资总额，若职工工资总额低于上年社会平均工资60%的，则按社会平均工资的60%缴费；高于上年社会平均工资60%的，则按实际工资缴费。

扣缴方式

单位从员工工资中直接扣除个人应缴部分，并将单位应缴部分从单位银行账户中扣除。具体操作步骤可能因地区和单位而异，但大致流程包括员工信息录入、社保费用计算、审核、缴费等。

续缴社保

对于新入职员工，单位需在其入职时录入信息并开始缴纳社保；对于原有参保员工，单位需将其参保信息转入续交；对于信息在外省的员工，可以先开户参保后再转入。

建议：

事业单位及其员工应详细了解当地社保和公积金的相关政策，确保按时足额缴纳，以保障员工的合法权益。