新疆事业单位改革主要遵循政事分开、事企分开和管办分离的原则，通过优化协同高效、实行“瘦身”和“健身”相结合的方式，严控事业单位编制总量，统筹使用，有增有减，动态平衡，保证重点，服务发展。具体改革内容如下：
取消事业编制
对于从事生产经营活动的事业单位，将在2020年前全部转企改制，注销事业单位法人，核销事业编制。在职职工将转为签订劳动合同，而不再是原有的事业单位聘用合同。
严控编制总量
新疆自治区事业单位机构编制管理工作必须坚持优化协同高效，实行“瘦身”和“健身”相结合，严控总量、统筹使用、有增有减、动态平衡、保证重点、服务发展。
分类推进改革
新疆分类推进事业单位改革工作大致的时间安排是，2013年完成事业单位分类，2015年完成行政类和经营类事业单位改革任务。在此基础上，进一步深化公益类事业单位改革，到2020年形成基本服务优先、供给水平适度、布局结构合理、服务公平公正的具有新疆特色的公益服务体系。
明确事业单位职责
事业单位职责任务是事业单位开展工作的主要依据。按照政事分开、事企分开的要求，明确事业单位承担的主要职责，应区别于行政机关、企业和社会团体。坚持一类事项原则上由一个部门统筹、一件事情原则上由一个部门负责。
改革创新管理方式
根据事业单位公益属性的不同，实施分类管理。实现政府管理职能和出资举办职能的适度分离，积极探索管办分离的有效实现形式，建立完善事业单位法人治理结构，加强对事业单位国有资产的管理。
安置原则
在事业单位改革中，按照规定随职能划分到其他单位，继续承担这些职务，以免因职能变动、工作发生脱节。承担行政职能的人员不遵循“编随事走、人随编走”的原则，公益类人员编制可以随同职能整合到新的事业单位，个人身份和编制类型不发生变化。
考核办法
新疆事业单位将改变以往对管理岗位、专业技术岗位、工勤技能岗位“一刀切”的考核方法，实施分类考核，力求全面、客观、准确评价工作人员德才表现和工作实绩。
这些改革措施旨在提高事业单位的运行效率和服务质量，更好地满足人民群众的需求，同时确保改革的平稳过渡和人员的合理安置。
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