制药专业考研的主要科目包括：

基础科目 ：

思想政治理论 ：所有考研学生的必考科目，测试学生的政治理论水平和时事政治的掌握程度。

外国语 ：通常为英语一，部分院校可能提供其他语言选项，如日语、俄语、德语、西班牙语等。

数学 ：数学二，测试学生的数学分析、线性代数等数学知识。

专业科目 ：

制药工艺学 ：涉及药物的制备过程、工艺设计等知识。

生物化学 ：研究生物体内发生的化学反应，是制药工程的重要基础学科。

化工原理 ：涉及化学工程的基本原理和操作，对于制药工程专业至关重要。

药物化学 ：研究药物的化学性质、合成方法和作用机制。

分子生物学 ：探讨生物分子的结构与功能，对生物制药方向尤为重要。

药剂学 ：研究药物的配制理论、生产技术以及合理应用。

药物分析 ：涉及药物的质量控制和分析方法。

药理学 ：研究药物与生物体之间的相互作用及其作用机制。

此外，有些院校可能会有一些特定的考试科目，例如：

药学基础综合 、 化学综合 、 医学综合 、 生物综合 等。

药用化学基础 、 医学基础 、 药学基础 、 生物学基础 、 药事法规 、 分析化学 、 微生物检验技术 、 药物合成技术 、 制药化工过程及设备 、 化工仪表与自动化 、 药物工艺设备 、 医药企业生产管理等。

无机化学 、 有机化学 、 仪器分析 、 物理化学 、 现代分子生物学 、 生物技术制药 、 制药工程原理与设备 、 药物合成反应 、 药物化学 、 药理学 、 药剂学 、 天然药物化学 、 应用光谱解析 、 制药工艺学 、 药用高分子材料 、 制药分离工程 、 药物分析 、 制药装备与车间设计 （制药工程实训）、 药事管理学 、 药品营销 等。

建议考生根据自己报考的院校和专业方向，仔细查阅相关院校的专业目录，了解具体的考试科目和要求，以便更好地准备考研。