水产兽医专业的课程主要分为以下几类：

专业基础课程

养殖水化学

水产微生物与免疫

水生生物学

水生动物养殖概论

水生动物解剖生理

水生动物组织胚胎

水生动物病理与药理

专业核心课程

鱼类病虫害防治

虾蟹类病虫害防治

名特水产病虫害防治

水质检测与调控

渔药使用与公共卫生安全

水生动物疫病检验检疫

水生动物药品营销与技术服务

兽医法规与渔业执法

其他相关课程

水产动物生物学

水产动物病原生物学

水产药物学

水产动物病理学

水产动物免疫学

鱼病学

水产无脊椎动物疾病学

水产动物疾病诊断学

水产养殖学概论

选修课程（可能根据学校和专业方向有所不同）：

渔业经济与管理

鱼类学

动物遗传育种学

水产动物病害学

水产动物环境生理学

生物饵料培养

观赏水族养殖学

水产动物营养与饲料

水产动物育种学

水产特种经济动物增养殖学

公共基础课程（可能包括）：

英语

思想政治

化学（农）或数学（农）

普通动物学与普通生态学

这些课程共同构成了水产兽医专业的知识体系，旨在培养学生全面掌握水生动物疾病的发生发展规律及其防控措施，能在相关领域从事病害防控、预防检疫、科学研究、教学、经营管理、技术开发与推广等工作。