专业注册学费的收取方式如下：

按学年收取：

专业注册学费是按照学生实际在校就读的学年收取的。学生在每学年期初需要交纳专业注册学费，并办理注册手续后，才能取得本学年的选课资格。

学分制收费：

专业注册学费通常与学分学费相结合，构成学分制收费体系。专业注册学费按学年收取，而学分学费则是根据学生修读课程的学分来计算和收取的。

不同专业的收费标准不同：

每个专业的专业注册学费都是不一样的，具体收费标准因学校、专业类型、合作模式等因素而异。例如，中国海洋大学的专业注册学费范围为1100-1500元、3800元、4700元/生·学年，而宁波大学的艺术类专业每生每学年为4000元，农林水师范专业每生每学年为1000元，其他专业每生每学年为1400元。

转专业后的学费调整：

学生在校期间如果转专业，从转专业后的下一学年起，需要按照新专业的专业注册学费标准交纳学费。

其他特殊情况：

提前一学年修满学分毕业的学生，不再收取专业注册费；提前一学期修满学分毕业的学生，减半收取专业注册费；在学期内修满学分毕业的学生，全额收取专业注册费。其他如退学、开除、休学、转学、出国等情况下，专业注册学费的退还也有相应的规定。

专业注册学费是按学年收取的，并且根据不同的专业、学校以及学生的学业情况，收费标准会有所不同。学生在入学时需了解并确认所在学校的专业注册学费标准和相关规定。