专科起点不同：

三年制大专是以高中为起点，统一参加高考并且过了大专录取分数线之后，被大专院校录取，就读三年，称为三年制大专；五年制大专是以初中为起点，初中生通过在中专、技校、或高职学校里就读五年，称为五年一贯制大专。

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转本考试时间、地点、报考院校不同：

三年制专转本是在专科生三年级第二学期的三月份参加江苏省统一考试，每个城市都设有考点，全省四十个院校都可以报考。

五年制专转本是高职在校生在其五年级第二学期四月份参加江苏省统一考试，但考点只局限在省内9所报考院校，分别是：1.南京晓庄学院2.金陵科技学院3.淮阴工学院4.苏州大学文正学院5.苏州大学应用技术学院6.三江学院7.南京医科大学康达学院8.南通大学（师范类）9.江苏第二师范学院（师范类）五年制专转本是要到报考院校参加的，以对口单招形式参考，所以五年一贯制高职在校生考前需确定好自己的意向院校和专业。

三年制，五年制转本考试科目、考试分数、招生机制不同：

三年制专转本考试科目只分文理科，文科考：语文、英语、计算机；理科考：数学、英语、计算机。其中计算机分值100分，其他两科各自为150分，总分值为400分。考生考完根据自己的成绩填写志愿，选择意向院校和专业，有多项选择权，然后等待本科院校录取。

五年一贯制专转本分专业，需专业对口禁止跨专业。考试科目：公共英语+2门专业课，每门各自为100分，总分300分。五年制专转本需先填写志愿，而且只能选择一所报考院校，选择空间较小。然后到填写的报考院校参加对应的专业考试，等待校方录取。