学历上的区别：三本院校虽然相对一本二本院校要差一些，但是三本依然是本科教育，修业年限一般是4年，毕业之后符合条件可以申领毕业证书和学位证书;而大专相对三本来说要低一个层次，修习年限一般是3年，毕业时只要毕业证书，没有学位证书。教学内容教育目标不同：三本更加注重理论知识的传授和学习，大专更加偏重实用性知识的讲解和技能的培养。

费用不同：三本因为是民办的大学院校，因国家不拨教育专款，由民间自筹资金，所以比起公立院校收费高，一般学费一年会在12000-20000之间。所以对于很多家庭条件不太好的学生读起来压力就比较大。而专科一般是公办的，费用会便宜很多。

毕业后的方向：三本和大专在考研、留学等方面是有很大差别的，如果考生想要考研或是出国，那么，尽量就要选择三本大学了。三本大学毕业的学生可以直接就报考研究生，而专科生想要考研的话，需要毕业满两年之后才能报考研究生。

所以如果想要在毕业后继续接受教育的考生，可以选择三本大学。而如果是毕业后想找一些技术类的工作的考生，也可以选择大专。就教育质量和个人专业能力而言，三本和大专没有太大区别。