南京财经大学重点学科有马克思主义理论、法学、统计学、数学、理论经济学、计算机科学与技术、工商管理、食品科学与工程、管理科学与工程、软件工程等，以下是具体名单，供大家参考，如有变动，以学校最新公布为准。
1、南京财经大学重点学科名单
“十三五”江苏省重点学科：马克思主义理论
江苏省重点（培育）学科：理论经济学、法学、马克思主义理论、外国语言文学、新闻传播学、数学、软件工程、管理科学与工程、公共管理
江苏高校优势学科建设工程三期项目：应用经济学、工商管理、食品科学与工程
校重点学科：管理科学与工程、软件工程、公共管理
校重点培育学科：设计学、新闻传播学、外国语言文学
2、南京财经大学学科评估结果排名（第四轮）
以下是南京财经大学第四轮学科评估结果排名情况，由于第五轮还未公布，这也是最新评估结果。
| 序号 | 学校代码 | 学校名称 | 一级学科名称 | 评选结果 |
| 1 | 10327 | 南京财经大学 | 应用经济学 | B |
| 2 | 10327 | 南京财经大学 | 工商管理 | B |
| 3 | 10327 | 南京财经大学 | 食品科学与工程 | B- |
| 4 | 10327 | 南京财经大学 | 理论经济学 | C+ |
| 5 | 10327 | 南京财经大学 | 统计学 | C+ |
| 6 | 10327 | 南京财经大学 | 法学 | C- |
| 7 | 10327 | 南京财经大学 | 马克思主义理论 | C- |
| 8 | 10327 | 南京财经大学 | 软件工程 | C- |
| 9 | 10327 | 南京财经大学 | 管理科学与工程 | C- |
