内蒙古自考本科允许符合条件的考生免考部分课程，考生仅需要在规定时间内通过网上提交申请材料，具体申请流程如下：

1、考生登录自学考试管理系统通过系统中考籍管理模块的凭等级证书申请免考模块提交申请：输入已获得的等级证书类型、级别、证书编号(CET、PETS笔试成绩输入准考证号)、成绩(只有CET证书和PETS笔试成绩两种类型需要输入)、获得证书年月、获得证书所在省份。同时输入要申请免考的课程代码，同一张证书可申请免考多门课程。

2、输入证书信息后，系统自动匹配考生输入的证书类型、证书编号、考生姓名、身份证号，如匹配成功，提示“证书查验通过，无需递交材料，审核时间约30个工作日，请注意审核结果。

3、如匹配不成功，系统提示“请将准考证、身份证、等级证书原件及复印件提交县(区)自考办初审。”考生需按规定的时间，到提交申请时选定的办理地点提交准考证、身份证、等级证书原件及复印件，并在等级证书复印件上注明考试所在的省份。

4、县(区)考办收集考生材料，打印《办理免考手续凭证》交考生，然后将考生材料统一集中报市考办。

5、市考办验核考生材料后，在复印件上签署意见并加盖公章，原件交县(区)考办退回考生，打印《免考审核表》与复印件材料一并上报省考办。

6、省考办审核后，不返回书面结果，考生通过系统查询审核结果。