内蒙古自考与函授的区别在于性质不同、学习方式不同、考试时间不同、考试方式、难度不同、证书含金量不同，具体如下：

性质不同

1、函授：成人高等教育的一种学习形式，属于高等教育层次的一种学习层次。

2、自考：个人自学和国家考试相结合的高等教育形式。

学习方式不同

1、函授学习方式：业余学习(夜大)和脱产学习(全日制)。

2、自考学习方式：

(1)高等学校学生辅助学习或本校全日制学习(学生使用这种被称为应用型考生的学习方法)。

(2)自学或在社会学习辅助单位学习(使用这种学习方法的学生称为社会考生)。

考试时间不同

1、函授考试时间：函授网上报名时间在每年8-9月份，考试时间在10月中下旬。

2、自考考试时间：自考每年举行两次(省级考试次数由省级考试办公室决定)。内蒙古考试时间分别是四月和十月。

考试方式、难度不同

成考入学叫严进宽出，学生只有通过国家统一的成人高考考试，才能入学就读。就像高考一样，也要填志愿。但只要你考上了，一般来说毕业都不会太困难(这与普高很相似);自考和学历文凭考试入学叫宽进严出，学员入学时不需要通过考试，直接就可入学，但如果你想得到国家承认的毕业证，就得一门一门的通过国家的考试。所不同的是，自考是全都是由国家出题考试，难度最大。

证书含金量不同

函授本科属于成人高考学历。成人高考需要参加高等院校统一组织考试，不过考试要求不高，考上也没有硬性要求，毕业难度不高。学完两年半即可，含金量一般。自考需要考完专业的所有科目，并且全部及格才可以申请毕业证，是有一定难度的，报考必须要有学信网可查的专科毕业证。毕业证书是所有成人学历里边最高的。