菏泽的公办本科大学排名如下：
菏泽学院
菏泽学院位于山东省菏泽市，是一所全日制普通本科高校，是数据中国“百校工程”项目建设院校。2002年，菏泽师范专科学校、菏泽教育学院、菏泽广播电视大学3所学校合并，同时并入菏泽师范学校、菏泽农业学校，筹建菏泽学院。2004年，教育部正式批准更名为菏泽学院。2011年，单县幼儿师范学校、郓城幼儿师范学校并入菏泽学院。2017年，学校成为省级硕士培育建设单位。
菏泽医学专科学校
菏泽医学专科学校位于中国牡丹之都——山东省菏泽市，是一所由山东省人民政府举办的省属公办全日制普通高等专科学校。菏泽医学专科学校的前身是1950年经国务院批准建立的平原省卫生学校；1958年，更名为菏泽地区医学专科学校，后又历经山东省菏泽地区卫生学校、山东省菏泽地区医学专科学校、山东省菏泽地区卫生学校等办学时期；1978年经国务院批准，更名为菏泽医学专科学校。
建议：
菏泽学院在本科教育方面具有较强的实力，并且近年来发展迅速，成为省级硕士培育建设单位，具有较高的学术和教育水平。
菏泽医学专科学校作为医学类专科院校，在医疗卫生领域具有悠久的办学历史和较高的声誉，为山东省基层医疗卫生人才培养做出了突出贡献。
