工程款的税费计算如下：

增值税

增值税率为17%。

5万元工程款的增值税为：5万 × 17% = 0.85万元。

附加税

城建税：根据纳税人所在地的不同，税率为7%、5%或1%。

教育费附加：按实际缴纳的增值税的3%缴纳。

地方教育费附加：按实际缴纳的增值税的2%缴纳。

印花税：按合同金额的0.3‰计算缴纳。

个人所得税

个人所得税税率为1%。

具体计算示例

假设工程所在地为市区，则：

增值税：0.85万元

城建税：0.85万元 × 7% = 0.0595万元

教育费附加：0.85万元 × 3% = 0.0255万元

地方教育费附加：0.85万元 × 2% = 0.017万元

印花税：5万元 × 0.3‰ = 0.015万元

个人所得税：5万元 × 1% = 0.05万元

总税额 = 增值税 + 城建税 + 教育费附加 + 地方教育费附加 + 印花税 + 个人所得税

= 0.85万元 + 0.0595万元 + 0.0255万元 + 0.017万元 + 0.015万元 + 0.05万元

= 1.017万元

5万元工程款的税费大约为 1.017万元。

建议

具体税率和附加费可能因地区和政策有所不同，建议在实际操作中咨询当地税务部门以获取最准确的税费计算。

发票开具和税费缴纳应严格按照国家相关税收法规进行，以确保合法合规。