工程超期赔偿的计算方式主要依据合同约定和相关法律法规。以下是主要的赔偿计算方式：
按合同约定的违约金计算
工程逾期违约金一般按照工程总额的千分之五按天计算。
若合同中未对工期延误赔偿金数额有明确约定，建议找专业的注册造价工程师代为计算。
按实际损失计算
未能按照承包合同的规定履行自己应负的责任，除竣工日期得以顺延外，还应赔偿承包人因此发生的实际损失。
工程中途停建、缓建或由于设计变更以及设计错误造成的返工，应采取措施弥补或减少损失，同时赔偿承包人由此而造成的停工、窝工、返工、倒运、人员和机械设备调迁、材料和构件积压的实际损失。
法律法规规定的违约金
国家法律法规规定工程延迟违约金一般是按照超出十日结付工程款，每延期一天，按照工程款总额的0.5%支付违约金。
误期赔偿费用的最高限额
合同工程发生误期的，除合同另有约定外，误期赔偿费的最高限额为合同价款的5%。
违约金与实际损失的平衡
当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。
如果约定的违约金超过造成损失的百分之三十，一般可以认定为合同法第114第二款规定的“过分高于造成的损失”，法院可以根据当事人的请求予以适当减少。
建议
明确合同条款：在签订工程合同时，应明确约定违约金的计算方式和限额，以避免后续纠纷。
收集证据：在工程超期的情况下，应收集相关证据，如施工日志、进度报告、合同文件等，以便在争议解决时提供支持。
咨询专业人士：在计算赔偿金额时，建议咨询专业的注册造价工程师或律师，以确保计算的准确性和合理性。
通过以上方式，可以更有效地解决工程超期赔偿问题，保障合同双方的合法权益。
