工程结算扣款会计分录主要包括以下几种情况：

实际发生成本时

借：工程施工-合同成本

贷：原材料等

结转收入成本时

借：主营业务成本

贷：工程施工-合同毛利

贷：主营业务收入

结算时

借：应收账款或银行存款等

贷：工程结算

完工时冲平

借：工程结算

贷：工程施工-合同毛利

贷：工程施工-合同成本

确认应收账款

当与甲方结算工程款，按照结算金额开具发票时，确认应收账款。

例如，结算100万元，增值税税率为9%，则不含税金额为91.74万元，增值税销项税额为8.26万元。

会计分录为：

借：应收账款甲方100万元

贷：工程结算91.74万元

贷：应交税费应交增值税（销项税额）8.26万元

收到工程款时

假设收到甲方支付的工程款80万元。

会计分录为：

借：银行存款80万元

贷：应收账款甲方80万元

工程竣工结算后对冲工程施工和工程结算科目

假设工程施工合同成本为70万元，工程施工合同毛利为21.74万元。

先将工程施工科目余额结转到工程结算科目。

会计分录为：

借：工程结算91.74万元

贷：工程施工合同成本70万元

贷：工程施工合同毛利21.74万元

这些分录涵盖了工程结算过程中涉及的主要会计处理，包括成本的记录、收入的确认、税费的计算以及应收账款的核对和冲销等。希望这些信息对你有所帮助。