在二楼安装止回阀存在以下弊端：

反水风险

二楼作为排水系统的中间层，如果上层（三楼及以上）的排水管堵塞，污水可能会直接从二楼的下水道冒出来，导致反水问题。尽管止回阀可以防止水倒流，但在堵塞情况下，止回阀可能无法完全解决问题，仍需人工处理。

阻力增加

止回阀会增加水流阻力，可能导致水流不畅，影响排水效率。特别是在水管拐角处，阻力增加可能会导致水无法顺利排出，甚至影响其他楼层的排水。

维护困难

止回阀如果损坏，特别是母管制系统，需要停运整个系统才能进行修理，这会给日常生活带来不便。

责任不清

如果二楼的管道堵塞导致反水，责任归属可能不明确。可能是二楼住户、一楼住户、物业或共同承担，具体情况需要具体分析。

影响上层排水

止回阀可能会影响上层（三楼及以上）的排水，因为水流阻力增加可能导致水无法顺利排出，进而影响上层住户的正常使用。

安装空间问题

安装止回阀需要预留一定的安装空间，这可能会对户型格局造成影响，特别是如果户型本身设计就不合理。

在二楼安装止回阀虽然可以防止水倒流，但也存在诸多弊端，包括增加阻力、维护困难、责任不清、影响上层排水和安装空间问题。在决定是否在二楼安装止回阀时，需要综合考虑这些因素，并咨询专业人士的意见。