一、培养方向不同统考难度和联考难度相差大，效力也不一样。硕士统考毕业为学术型硕士，是培养学术研究型人才。硕士联考和同等学力申硕毕业为专业硕士，是培养应用型和工程研究型人才。
二、招生考试不同对学生来说，普通硕士的招生考试只有年初的统考，而统考以外的专业考试则由各招生单位自行命题、阅卷。专业硕士的招生考试有10月份的联考和年初的统考两次机会，考生可以自行选择，而这两大国家级别的考试的专业考试，也由各招生单位自行命题、阅卷。不过全日制专业硕士不同于在职硕士，两者虽然名字差不多但是实际上明显不同，而参加统考的全日制专业型硕士是将取代全日制MBA学术型硕士的种类。
三、统考难度和联考的难度完全不是同一个级别，研究生统考就是我们常说的考研，就是报考290万人屡屡上热搜的研究生考试。全国统考只能报考除管理类和法律硕士外的学科(类别)和专业(领域)。而全国联考又分为管理类联考和法硕联考，管理类联考只能报考工商管理硕士、公共管理硕士、旅游管理硕士、工程管理硕士、会计硕士、图书情报硕士、审计硕士。
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