本一级学科中，全国具有“博士授权”的高校共41所，本次参评37所；部分具有“硕士授权”的高校也参加了评估；参评高校共计104所。 （注：评估结果相同的高校排序不分先后，按学校代码排列）
| A+ | 10023北京协和医学院 |
| 10316中国药科大学 | |
| A | 10001北京大学 |
| 10163沈阳药科大学 | |
| 10335浙江大学 | |
| A- | 10246复旦大学 |
| 10248上海交通大学 | |
| 10422山东大学 | |
| 10558中山大学 | |
| 10610四川大学 | |
| 91020海军军医大学（第二军医大学） | |
| B+ | 10025首都医科大学 |
| 10226哈尔滨医科大学 | |
| 10251华东理工大学 | |
| 10285苏州大学 | |
| 10423中国海洋大学 | |
| 10486武汉大学 | |
| 10487华中科技大学 | |
| 10533中南大学 | |
| 91030空军军医大学（第四军医大学） | |
| B | 10055南开大学 |
| 10062天津医科大学 | |
| 10159中国医科大学 | |
| 10183吉林大学 | |
| 10312南京医科大学 | |
| 10337浙江工业大学 | |
| 10366安徽医科大学 | |
| 10459郑州大学 | |
| 10573广东药科大学 | |
| 10698西安交通大学 | |
| 12121南方医科大学 | |
| B- | 10089河北医科大学 |
| 10162辽宁中医药大学 | |
| 10184延边大学 | |
| 10228黑龙江中医药大学 | |
| 10315南京中医药大学 | |
| 10343温州医科大学 | |
| 10384厦门大学 | |
| 10559暨南大学 | |
| 10631重庆医科大学 | |
| 10760新疆医科大学 | |
| C+ | 10063天津中医药大学 |
| 10161大连医科大学 | |
| 10291南京工业大学 | |
| 10295江南大学 | |
| 10299江苏大学 | |
| 10313徐州医科大学 | |
| 10344浙江中医药大学 | |
| 10541湖南中医药大学 | |
| 10598广西医科大学 | |
| 10660贵州医科大学 | |
| 10730兰州大学 | |
| C | 10057天津科技大学 |
| 10114山西医科大学 | |
| 10403南昌大学 | |
| 10441山东中医药大学 | |
| 10560汕头大学 | |
| 10570广州医科大学 | |
| 10633成都中医药大学 | |
| 10661遵义医学院 | |
| 10678昆明医科大学 | |
| 11066烟台大学 | |
| C- | 10010北京化工大学 |
| 10247同济大学 | |
| 10369安徽中医药大学 | |
| 10427济南大学 | |
| 10472新乡医学院 | |
| 10507湖北中医药大学 | |
| 10572广州中医药大学 | |
| 10613西南交通大学 | |
| 11065青岛大学 | |
| 11079成都学院 |
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