东京大学是一所位于日本的顶尖综合性大学，拥有广泛的专业设置，覆盖从人文科学到理工科学的各个领域。东京大学提供50个本科专业和96个研究生专业，其专业结构如下：
工学部：
23个系109个讲座，涵盖土木、机械、电子、船舶、航空、原子能、资源、金属、材料、应用化学、应用物理、计算等领域。
经济学部：
包括经济学和经营学两系，附属有日本产业经济研究室。
理学部：
设有数学、信息科学、物理、天文、地球物理、化学、生物化学、生物科学、地学9系，附属部门有临海实验场、植物园等。
法学部：
历史最悠久，设有民主、公法、政治学3系，附属部门有外国法文献中心等。
文学部：
设有文学、史学、语言学、行动学4系，附设文化交流、北海文化研究实习实验部门。
教育学部：
设有教育学、教育心理学、学校教育、教育行政、体育和健康教育5系，附属学校有中学、高中各一所。
医学部：
设有医学和健康护理学两系，附设脑研究实验室等。
教养学部：
负责全校低年级学生的公共基础课，下设综合文化、地区文化等5系。
农学部：
开设农业生物学、农业化学等8系，附设有农场等实习实验设施。
药学部：
只含药学和制药化学两系，附设药用植物园。
东京大学不仅在专业数量上丰富，其学术实力也处于日本乃至世界的前沿。学校实行弹性教育，学生可以根据自己的兴趣和能力在10个学部中选择专业。东京大学拥有15个研究生院，提供更高层次的学术和研究教育。
