复旦大学截至2024年设有多个直属院系和学院，具体包括以下：
中国语言文学系
外国语言文学学院
新闻学院
历史学系
文物与博物馆学系
哲学学院
社会发展与公共政策学院
国际关系与公共事务学院
法学院
经济学院
数学科学学院
物理学系
核科学与技术系
化学系
生命科学学院
高分子科学系
环境科学与工程系
信息科学与工程学院
软件学院
光源与照明工程系
材料科学系
力学与工程科学系
微电子学院
大数据学院
航空航天系
核科学与技术系
公共卫生学院
药学院
护理学院
国际文化交流学院
31. 国际问题研究院
32. 社会科学高等研究院
33. 文史研究院
34. 现代语言学研究院
35. 泛海国际金融学院
36. 马克思主义学院
37. 高等教育研究所
38. 古籍整理研究所
39. 分析测试中心
40. 实验动物科学部
41. 出土文献与古文字研究中心
42. 六次产业研究院
43. 全球公共政策研究院
44. 科技考古研究院
45. 马克思主义研究院
46. 体育教学部
47. 继续教育学院
48. 艺术教育中心
49. 分析测试中心
50. 实验动物科学部
51. 出土文献与古文字研究中心
52. 高等教育研究所
53. 古籍整理研究所
54. 国际问题研究院
55. 科技考古研究院
56. 马克思主义研究院
57. 全球公共政策研究院
58. 社会科学高等研究院
59. 文史研究院
60. 现代语言学研究院
这些院系和学院涵盖了人文学科、社会科学、理学、工学、医学等多个领域，为学生提供了广泛的专业选择。
