南京大学拥有 四个校区，分别是仙林校区、鼓楼校区、浦口校区和苏州校区。每个校区都有其特色和专业分布。
仙林校区：
作为南京大学的主校区，仙林校区主要容纳部分理工科、社会学科和人文学科等。国际化特色鲜明，设施全面，生活方便。
鼓楼校区：
鼓楼校区是南京大学原本的主校区，地理位置居于市中，保留了部分理科基础学科、文科应用学科和医学院，以及部分学科四年级本科生和研究生。
浦口校区：
浦口校区主要作为金陵学院（独立学院）、模式动物研究所等单位的教学和研究的主要场所。
苏州校区：
苏州校区在2023年正式启用，主要计划容纳应用型学科。
南京大学的推荐学科包括天文学（A+）、地质学（A+）、图书情报与档案管理（A+）、哲学（A）、社会学（A）、中国语言文学（A）、外国语言文学（A）、中国史（A）、物理学（A）、生物学（A）、计算机科学与技术（A）、环境科学与工程（A）、软件工程（A）、工商管理（A）。
建议：
仙林校区：适合对理工科、社会学科和人文学科有浓厚兴趣的学生。
鼓楼校区：适合希望在市中心学习并接触更多应用学科的学生。
浦口校区：适合对独立学院和研究所感兴趣的学生的。
苏州校区：适合希望在环境优美且注重应用型学科的学生。
