东京大学和清华大学都是世界知名的顶尖大学，各有其独特的优势和特点。具体哪个更好需要根据不同的需求和标准来评判。

世界排名

根据多个国际排名机构的数据，清华大学和东京大学通常在排名中非常接近，有时清华大学略占优势，有时东京大学略占优势。

学科优势

清华大学：在计算机科学、电子工程、工程等领域表现出色，尤其在理工科领域享有很高的声誉。

东京大学：在人文社会科学、数学、生命科学、医学、自然科学等领域较为领先，尤其在工程技术类学科中也有很高的排名。

师资力量和教学水平

两所大学的教授和教学团队都非常优秀，都以学术规范严谨、注重实践教学而著称。

科研和创新能力

清华大学在信息技术、电子工程、自动化工程、航天航空等领域拥有较强的发展能力，而东京大学在医科、自然科学、信息科技、航天工程等领域较为有优势。

国际化水平

东京大学有着优秀的国际化教学团队，教授来自不同的国家和地区，学生可以接触到不同的文化和学风。清华大学的师资队伍也非常雄厚，许多教授曾先后在世界各大知名高校工作过。

学生生活和就业环境

两所大学都位于各自国家的首都，学生生活和学习的环境都相当好。对于毕业后的就业环境，两所大学也都非常优越，许多知名企业和机构都很欢迎这两个大学的毕业生。

建议

如果你想在工程、计算机科学等领域深造，清华大学可能更适合你。

如果你想学习日语、日本文化等方面，东京大学可能更适合你。

如果你决定以后定居日本或在日本工作和长期生活，从学生时代就具备明确的目标并制定了相应的计划，那么建议你选择东京大学。

如果你只打算去日本留学，毕业后第一时间回国找工作、稳定发展的话，建议你直接考虑国内的清华大学。

两所大学都是非常优秀的学府，选择哪个更好应该根据自己的兴趣和需求来决定。