1、硅藻泥的表面的纹理十分的粗糙，不像油漆表面那样光滑富有光泽，它的造型也是十分的单一，不像墙纸的花色会那么的丰富，颜色一般是以淡雅为主，所以色彩不够活力，对于硅藻泥的手感摸上去会有木材的感觉，质感较差的手感会特别的粗糙，没有柔性，所以对于喜欢光滑手感的朋友则不推荐使用硅藻泥。
2、硅藻泥不耐脏。这是由于硅藻泥大多是淡色调的，在有小孩的家庭里，很容易留下小孩玩耍的手印脚印之类的各种污迹。另外，由于硅藻泥本身能够吸附和分解空气中的灰尘等有害物质，但是如果长时间不进行清理，会把墙壁的颜色改变，令家居环境变得肮脏不堪，所以硅藻泥墙壁要经常清理。
3、清洁困难。硅藻泥墙面是不可以直接擦洗的，这是由于硅藻泥的天然属性是泥，泥是不能擦洗的。再者硅藻泥本身的结构是纳米的蜂窝状结构，他的吸附性要比活性炭高300倍，一旦用水擦拭可能就会直接吸附到分子结构中去，起不到清洁的作用。所以，硅藻泥墙面弄脏不能选择用水擦洗。
4、硅藻泥在潮湿的空间下十分容易发霉，自身的特性就会发生了改变，比如会出现成泥的现象。而在市面上一般对于硅藻泥的宣传就是吸水性能好，能够调节室内的温度，虽然吸水是没错的，但是所吸收的水分全部都是被硅藻泥所吸收了，所以当在这种十分潮湿的环境之下，墙面就会很容易出现一些问题。特别是在南方的梅雨天，湿气比较重的地方如果使用硅藻泥则可能会出现软掉的情况，所以不建议使用。
5、硅藻泥的硬度会比较差，耐磨度不够，稍微被比较硬的家具磕碰到，则会影响到墙面的平整度，甚至还会出现掉渣掉皮的现象，这样就会使墙面不够美观了，也会极不耐脏，非常容易沾灰尘，而且如果脏了是不能用水清洗的，所以这是一个非常让人头疼的问题。
6、硅藻泥的价格相比于其它的装饰材料价格来说是比较高的了，一般会在两百元一平米左右了，相比油漆涂料来说它使用的周期比较短，对于在后期想换风格的施工也会比较的麻烦。
