在在职研究生教育资配置的过程中引入市场化的思想和市场化的竞争机制，通过在职研究生教育规模与结构的市场调节作用，促进在职研究生教育资源配置效率的提高。同时在市场化机制下，将投入产出、成本收益、资源配置等经济学理念引入公共教育领域。政府拨款将更关注教育的投入与产出，教育投资的拨款与办学效益联系更加紧密，市场机制就像无形的手，有效调节着有限的在职研究生教育资源，使之流动到最需要的地方。

加强拨款过程中绩效意识，创造更具活力和公平性的竞争性机制。实行信息公开，促进经费分配的更高效更透明。加强财政拨款方面的立法，规范政府行为，监督高校的资源配置过程。通过建立学生上诉制度逐步形成媒体、公众的广泛参与的全民舆论监督机制。对于违规和腐败行为进行严肃处理，通过制度的约束和有效的行政管理和行政手段的双重作用促进政府拨款行为的进一步完善。二、加强监督管理，避免拨款中的恶性竞争

随着在职研究生绩效思想和方法在拨款中的运用，一定程度上在政府拨款的过程中引入了竞争机制，但是由于绩效评价制度的不健全和具体评价标准的不完善，在实际的绩效拨款过程中依然存在着很多不公平的恶性竞争行为，因此必须加快建立一套完整的科学的绩效考评流程和制度，规范竞争中的不公平行为，创建更良好的公平竞争环境。例如，"211工程"、"985工程"的实施体现了效率优先，兼顾公平"的思想，比较好地促进了我国培养有专门知识和技能的人才的教育资源配置效率的提高，但是由于进入这两个工程的高校的确定始于不公平的竞争条件，投入的极大不均衡使校际差距更加显著，呈现两极分化，因此其实施的公平性还是受到了争议。建议改进竞争性科研经费的拨款模式，在相同层次的高校和专业之间设置绩效考评和竞争机制，同类比较的方式能够更好地实现真正意义上的绩效竞争以及保证竞争的公平性。同时要打破部门利益分割对经费资源的垄断作用，使高校在公平的竞争中获得应有的经费。最后通过设置相应的扶持资金项目来帮助弱势学校和学科的发展。

建议成立专门的在职研究生教育政府拨款的监督部门，以第三方"的身份存在于大学与政府之间，作为中介机构负责高校的非竞争性事业费拨款和竞争性的科研经费拨款，减少政府对高校的过多干涉和政府对高校政策的倾斜。