湄洲湾职业技术学院设有智能制造工程系、化学工程系、信息工程、自动化工程系、工商管理系、工艺美术系、建筑工程系、学前教育系、医学与健康系、基础教育学院及其他院系，以下是具体名单，以供参考，可调整的，以学校最新公告为准。

1、学院

智能制造工程系

化学工程系

信息工程

自动化工程系

工商管理系

工艺美术系

建筑工程系

学前教育系

医学与健康系

基础教育学院

马克思主义学院

继续教育

东软现代工业研究院

软件学院

2、湄洲湾职业技术学院简介

湄洲湾职业技术学院是莆田市人民政府举办的一所全日制普通高等职业学校、教育部第二批现代学徒制试点单位、教育部1+X证书制度试点院校、国立职业学院数字化校园实验学校、第三批国家高职院校体育“一校一品”示范基地、国家新型职业农民培育示范基地、福建省示范性现代高等职业院校、福建省新型职业农民培育示范基地、福建省高技能人才培养基地、福建省高校毕业生创业实训基地、福建省高校毕业生创业孵化基地、福建大学石油化工人才培养基地。

湄洲湾职业技术学院前身为创建于1985年的湄洲湾工业学校，2004年2月经福建省人民政府批准、教育部注册成立。