哈尔滨工程大学2021在全国本科院校排名第63位，强于第64名的中国矿业大学，第65名的华南师范大学，第66名的东北师范大学，第67名的燕山大学，第68名的扬州大学。在黑龙江排第2名，强于第3名的东北农业大学，第4名的东北林业大学，第5名的黑龙江大学，第6名的哈尔滨医科大学，第7名的哈尔滨理工大学。

综合实力排名（校友会版）

哈尔滨工程大学2021在全国本科院校排名第55位，强于第56名的东北师范大学，第56名的上海财经大学，第57名的中国政法大学，第57名的云南大学，第57名的深圳大学。在黑龙江排第2名，强于第3名的黑龙江大学，第4名的东北林业大学，第5名的东北农业大学，第6名的哈尔滨理工大学，第7名的哈尔滨师范大学。

综合实力排名（软科版）

哈尔滨工程大学2021在全国本科院校排名第50位，强于第51名的西南交通大学，第52名的南京农业大学，第53名的郑州大学，第54名的北京邮电大学，第55名的武汉理工大学。在黑龙江排第2名，强于第3名的东北林业大学，第4名的东北农业大学，第5名的黑龙江大学，第6名的哈尔滨理工大学，第7名的哈尔滨师范大学。