吉林农业大学2021在全国本科院校排名第239位，强于第240名的集美大学，第241名的南华大学，第242名的东北石油大学，第243名的湖北工业大学，第244名的哈尔滨师范大学。在吉林排第5名，强于第6名的长春工业大学，第7名的东北电力大学，第8名的北华大学，第9名的吉林师范大学，第10名的吉林财经大学。

综合实力排名（校友会版）

吉林农业大学2021在全国本科院校排名第129位，强于第131名的南方科技大学，第132名的山东财经大学，第132名的安徽农业大学，第132名的华北电力大学，第135名的云南民族大学。在吉林排第3名，强于第4名的东北电力大学，第5名的长春理工大学，第6名的延边大学，第7名的长春工业大学，第8名的北华大学。

综合实力排名（软科版）

吉林农业大学2021在全国本科院校排名第160位，强于第161名的青岛科技大学，第162名的西北师范大学，第165名的石河子大学，第166名的上海海洋大学，第167名的三峡大学。在吉林排第3名，强于第4名的长春理工大学，第5名的延边大学，第6名的东北电力大学，第7名的长春工业大学，第8名的吉林师范大学。