南方科技大学2021在全国本科院校排名第208位，强于第209名的曲阜师范大学，第210名的三峡大学，第211名的南京艺术学院，第212名的河南农业大学，第213名的河北农业大学。在广东排第12名，强于第13名的广州中医药大学，第14名的广州医科大学，第15名的广东财经大学，第16名的广东海洋大学，第17名的广东技术师范大学。

综合实力排名（校友会版）

南方科技大学2021在全国本科院校排名第131位，强于第132名的山东财经大学，第132名的安徽农业大学，第132名的华北电力大学，第135名的云南民族大学，第135名的长沙理工大学。在广东排第9名，强于第10名的广州大学，第11名的东莞理工学院，第12名的汕头大学，第13名的广东财经大学，第14名的广东海洋大学。

综合实力排名（软科版）

南方科技大学2021在全国本科院校排名第41位，强于第42名的华中农业大学，第43名的上海大学，第44名的苏州大学，第45名的华东理工大学，第46名的华中师范大学。在广东排第3名，强于第4名的暨南大学，第5名的深圳大学，第6名的华南师范大学，第7名的华南农业大学，第8名的广州大学。