在全国本科院校排名第789位，在新疆排第11名。
| 竞争力排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2015 | 798 | 新疆工程学院 | 新疆 | 11 |
综合实力排名（校友会版）
新疆工程学院2021在全国本科院校排名第343位，强于第349名的吉林工程技术师范学院，第349名的天水师范学院，第349名的湖南城市学院，第349名的韶关学院，第349名的金陵科技学院。在新疆排第7名，强于第8名的喀什大学，第9名的伊犁师范大学，第10名的昌吉学院，第11名的新疆政法学院，第12名的新疆理工学院。
| 校友会排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2021 | 343 | 新疆工程学院 | 新疆 | 7 |
| 2020 | 548 | 新疆工程学院 | 新疆 | 11 |
| 2019 | 625 | 新疆工程学院 | 新疆 | 10 |
| 2018 | 659 | 新疆工程学院 | 新疆 | 11 |
| 2017 | 667 | 新疆工程学院 | 新疆 | 11 |
综合实力排名（软科版）
新疆工程学院2021在全国本科院校排名第560位，强于第561名的普洱学院，第562名的萍乡学院，第563名的集宁师范学院，第564名的滇西科技师范学院，第565名的太原工业学院。在新疆排第8名，强于第9名的新疆理工学院，第10名的昌吉学院，第11名的新疆政法学院。
| 软科排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2021 | 560 | 新疆工程学院 | 新疆 | 8 |
| 2020 | 548 | 新疆工程学院 | 新疆 | 9 |
