山东农业工程学院2021在全国本科院校排名第755位，强于第756名的陕西学前师范学院，第757名的新余学院，第758名的安康学院，第759名的保定学院，第760名的山东政法学院。在山东排第43名，强于第44名的山东政法学院，第45名的山东警察学院，第46名的山东管理学院。
| 竞争力排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2021 | 755 | 山东农业工程学院 | 山东 | 43 |
| 2020 | 759 | 山东农业工程学院 | 山东 | 43 |
| 2015 | 840 | 山东农业工程学院 | 山东 | 51 |
综合实力排名（校友会版）
山东农业工程学院2021在全国本科院校排名第485位，强于第490名的营口理工学院，第490名的宿迁学院，第490名的普洱学院，第490名的鄂尔多斯应用技术学院，第490名的河套学院。在山东排第34名。
| 校友会排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2021 | 485 | 山东农业工程学院 | 山东 | 34 |
| 2020 | 616 | 山东农业工程学院 | 山东 | 44 |
| 2019 | 696 | 山东农业工程学院 | 山东 | 37 |
| 2018 | 694 | 山东农业工程学院 | 山东 | 40 |
| 2017 | 695 | 山东农业工程学院 | 山东 | 40 |
综合实力排名（软科版）
山东农业工程学院2021在全国本科院校排名第503位，强于第504名的蚌埠学院，第505名的怀化学院，第506名的新余学院，第507名的邵阳学院，第508名的河南工程学院。在山东排第28名，强于第29名的济宁学院，第30名的菏泽学院，第31名的山东女子学院，第32名的山东青年政治学院，第33名的枣庄学院。
| 软科排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2021 | 503 | 山东农业工程学院 | 山东 | 28 |
| 2020 | 563 | 山东农业工程学院 | 山东 | 32 |
