内蒙古科技职业学院有医学技术系、教育系、汽车工程系、经济管理系、艺术与传媒系、建筑工程系等院系，以下是具体名单一览表，供大家参考，如有变动，以学校最新公布的信息为准。
院系设置
医学技术系
教育系
汽车工程系
经济管理系
艺术与传媒系
建筑工程系
内蒙古科技职业学院简介
内蒙古科技职业学院位于自治区首府呼和浩特市，是经内蒙古自治区人民政府批准成立的全日制普通高校，学院成立于1991年，前身为内蒙古科技专修学院。2006年经内蒙古自治区人民政府批准、教育部备案，纳入国家高等教育序列，成为统一招生录取的全日制高等职业学院。
学院是内蒙古自治区“先进办学单位”、“就业先进单位”、“学生资助工作先进单位”、“教育部示范性实训基地”，设有国家职业技能鉴定站、 普通话水平测试站、数字视频DV策划师命题考试机构、全国计算机应用技术证书考试（NIT）内蒙古考试培训中心、国家大学毕业生创业培训基地。
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