菏泽职业学院有旅游管理系、信息工程系、经济管理系、商贸物流系、机电工程系、建筑与化工学院、交通工程系、基础教学部、马克思主义教学部、学前教育系（育中教育学院）等院系，以下是具体名单一览表，供大家参考，如有变动，以学校最新公布的信息为准。

院系设置

旅游管理系信息工程系经济管理系商贸物流系机电工程系建筑与化工学院交通工程系基础教学部马克思主义教学部学前教育系（育中教育学院）创新创业学院国际交流学院继续教育学院

菏泽职业学院简介

菏泽职业学院（Heze Vocational College）坐落于山东省菏泽市，是经山东省人民政府批准、国家教育部备案的国办全日制普通高等学校，先后被命名为全国智能制造领域中外人文交流人才培养基地、全国退役士兵职业技能培训基地、中国牡丹产业人才培训基地、山东省外包服务培训基地、山东省跨境电商培训基地、山东省旅游产学研合作基地、山东省华文教育基地、山东省中华文化传承基地、山东省百佳学生资助工作单位。

学校始建于1963年，时名菏泽供销学校；

2012年12月12日，省政府批准菏泽职业学院在整合山东菏泽信息工程学校、菏泽工业学校、菏泽财经学校三校资源上正式建院。