事业单位和企业单位的退休制度是不同的，即双方的缴费时间和缴费部分都是有一定的区别，所以导致了双方的养老金在数额上面会有一点点不同。且缴纳的费用也有大致上不一样的地方。

1、机关事业单位退休人员的养老金就有四部分构成，基础养老金，个人账户养老金，过渡性养老金和职业年金。企业的养老金是由基础养老金，个人账户养老金和过渡性养老金三部分组成。

2、事业单位养老保险缴纳采取挂账缴纳方式，退休时由财政一次划拨记实，缴纳基数为档案工资和离退休费之和。企业养老保险缴纳采取实额缴纳方式，中间不得间断，最少连续缴纳15年，缴纳基数为实发工资或者社会平均工资。

3、事业单位在养老保险缴纳基础上实行了职业年金制度，单位缴纳8%，个人缴纳4%，作为养老保险补充，使事业单位干部职工退休后待遇不降低。而企业缴纳职业年金的寥寥无几。

4、事业单位退休工资由本人缴费年限、退休、退职前岗位和薪级工资之和的一定比例计发。企业退休金由基础养老金和个人账户养老金组成，基础养老金月标准以本人退休时全省上年度在岗职工月平均工资和本人指数化月平均缴费工资的平均值为基数，缴费每满1年发给1%。个人账户养老金月标准为个人账户储存额除以计发月数。

5、事业单位养老保险制度相对于企业更完善，更人性化，退休金比企业更高。但是自收自支事业单位养老金缴纳方式和发放与企业是一样的，不同于全额事业单位。