自考电气自动化专业可以考二级建造师。因为首先自考属于国家承认学历，其次电气自动化专业属于工程类专业，因此只要报考人员具备自考电气自动化专业中专及以上学历，同时从事建设工程项目施工管理工作满两年，就可以报名参加二级建造师考试。

二级建造师报考条件要求如下：

考全科：凡遵纪守法，具备工程类或工程经济类中等专科以上学历并从事建设工程项目施工管理工作满2年的人员，可报名参加二级建造师执业资格考试。

免试部分科目：

符合上述报名条件，具有工程（工程经济类）中级及以上专业技术职称或从事建设工程项目施工管理工作满15年的人员，同时符合下列条件的，可免试部分科目：

免二科：已取得建设行政主管部门颁发的《建筑业企业一级项目经理资质证书》，可免试《建设工程施工管理》和《建设工程法规及相关知识》科目，只参加《专业工程管理与实务》1个科目的考试。

免一科：已取得建设行政主管部门颁发的《建筑业企业二级项目经理资质证书》，可免试《建设工程施工管理》科目，只参加《建设工程法规及相关知识》和《专业工程管理与实务》2个科目的考试。

增项：须已取得《中华人民共和国二级建造师执业资格证书》。