从水质来看,抚仙湖的水质要比泸沽湖好。主要有以下几个方面:
一、物种丰富度
抚仙湖水质优良,物种丰富,水生植物和鱼类品种超过100种。而泸沽湖水质较差,水生物种相对单一。
二、营养盐浓度
抚仙湖作为一个严格保护的生态湖,其总磷、总氮等营养盐浓度维持在较低水平。而泸沽湖受附近城镇及农业污染,营养盐高于正常水平。
三、藻类及浮游动物
抚仙湖藻类及浮游动物种类较少,cyanobacteria 等滋生较快的藻类较少。而泸沽湖藻类因受营养盐高污染,滋生较快。
四、出水时间
抚仙湖出水相对稳定,出水时间较长。泸沽湖受季节性水文影响,出水时间短。
综上,抚仙湖受到较好的保护管理,水质优良。而泸沽湖受人类活动影响,尤其是农业排放严重,水质相对差一些。


