福建农林大学重点学科有植物病理学、作物遗传育种、林学、林业工程、风景园林学、生物学、生态学、农业资源与环境、农林经济管理等，以下是具体名单，供大家参考，如有变动，以学校最新公布为准。
1、福建农林大学重点学科名单
国家、部级重点学科情况：
| 序号 | 类别 | 学科名称 |
| 1 | 国家重点学科 | 植物病理学 |
| 2 | 国家重点（培育）学科 | 作物遗传育种 |
| 3 | 农业农村部重点学科（2个） | 植物病理学 |
| 作物遗传育种 | ||
| 国家林业和草原局重点学科(7个) | 林学 | |
| 林业工程 | ||
| 风景园林学 | ||
| 生物学 | ||
| 生态学 | ||
| 农业资源与环境 | ||
| 农林经济管理 |
省高峰、高原学科情况：
| 类别 | 学科名称 |
| 高峰学科（6个） | 植物保护 |
| 作物学 | |
| 林学 | |
| 食品科学与工程 | |
| 林业工程 | |
| 农业资源与环境 | |
| 高原学科（12个） | 园艺学 |
| 农林经济管理 | |
| 生物学 | |
| 生态学 | |
| 风景园林学 | |
| 马克思主义理论 | |
| 农业工程 | |
| 环境科学与工程 | |
| 畜牧学 | |
| 兽医学 | |
| 工商管理 | |
| 公共管理 |
以下是福建农林大学第四轮学科评估结果排名情况，由于第五轮还未公布，这也是最新评估结果。
| 序号 | 学校代码 | 学校名称 | 一级学科名称 | 评选结果 |
| 1 | 10389 | 福建农林大学 | 生态学 | B+ |
| 2 | 10389 | 福建农林大学 | 风景园林学 | B+ |
| 3 | 10389 | 福建农林大学 | 植物保护 | B+ |
| 4 | 10389 | 福建农林大学 | 林学 | B+ |
| 5 | 10389 | 福建农林大学 | 生物学 | B |
| 6 | 10389 | 福建农林大学 | 食品科学与工程 | B |
| 7 | 10389 | 福建农林大学 | 林业工程 | B- |
| 8 | 10389 | 福建农林大学 | 园艺学 | B- |
| 9 | 10389 | 福建农林大学 | 农业资源与环境 | B- |
| 10 | 10389 | 福建农林大学 | 农林经济管理 | B- |
| 11 | 10389 | 福建农林大学 | 马克思主义理论 | C+ |
| 12 | 10389 | 福建农林大学 | 作物学 | C+ |
| 13 | 10389 | 福建农林大学 | 公共管理 | C+ |
| 14 | 10389 | 福建农林大学 | 畜牧学 | C |
| 15 | 10389 | 福建农林大学 | 统计学 | C- |
| 16 | 10389 | 福建农林大学 | 兽医学 | C- |
| 17 | 10389 | 福建农林大学 | 工商管理 | C- |
