两者存在多个方面的区别。
从形态上看,硅藻的细胞壁含有丰富的硅,大多有美丽的花纹,由相互扣合的两瓣组成,形似圆形药丸盒。而螺旋藻的藻丝体为单列细胞构成无分支、无异性胞的丝状体,通常呈蓝绿色,藻丝体具规则的螺旋状卷曲结构,整体可呈圆柱形、纺锤形或哑铃型。
在生存环境上,硅藻主要分布于淡水或海水中,作为水生态系统中重要的初级生产者,可以反映出水环境的平均状况。而螺旋藻则分布于光照充足、温度适宜的盐碱湖中,最早发现于非洲乍得湖,中国鄂尔多斯盐碱湖也有分布。螺旋藻喜高温,耐盐碱,经驯化后可适应海水养殖。
在用途上,硅藻的细胞壳化石构成多孔岩石,称为硅藻土,可以用来制造过滤器、绝缘体、磨料等。而螺旋藻的蛋白质含量高,含有一种特殊色素蛋白——藻蓝蛋白,以及萝卜素和维生素,含有人体必需的大量元素和微量元素,具有极高的营养价值。
硅藻和螺旋藻在形态、生存环境以及用途上均存在明显的区别。


