黑龙江省共有19所二本大学参与了2016黑龙江二本大学排名，其中排名第一的是哈尔滨理工大学，排名第二的是哈尔滨师范大学，排名第三的是东北石油大学，排名前10的大学还有黑龙江中医药大学、哈尔滨商业大学、齐齐哈尔大学、黑龙江科技大学、黑龙江八一农垦大学、佳木斯大学、黑龙江工程学院，以下是黑龙江二本大学排名2016具体榜单：
| 黑龙江二本大学排名 | 全国排名 | 学校名称 | 学校类型 |
| 1 | 167 | 哈尔滨理工大学 | 理工 |
| 2 | 181 | 哈尔滨师范大学 | 师范 |
| 3 | 184 | 东北石油大学 | 理工 |
| 4 | 235 | 黑龙江中医药大学 | 医药 |
| 5 | 275 | 哈尔滨商业大学 | 财经 |
| 6 | 325 | 齐齐哈尔大学 | 综合 |
| 7 | 355 | 黑龙江科技大学 | 理工 |
| 8 | 355 | 黑龙江八一农垦大学 | 农林 |
| 9 | 372 | 佳木斯大学 | 综合 |
| 10 | 381 | 黑龙江工程学院 | 理工 |
| 11 | 489 | 牡丹江师范学院 | 师范 |
| 12 | 506 | 牡丹江医学院 | 医药 |
| 13 | 521 | 绥化学院 | 综合 |
| 14 | 525 | 哈尔滨金融学院 | 财经 |
| 15 | 583 | 黑河学院 | 综合 |
| 16 | 592 | 哈尔滨学院 | 综合 |
| 17 | 592 | 黑龙江工业学院 | 理工 |
| 18 | 601 | 齐齐哈尔医学院 | 医药 |
| 19 | 615 | 大庆师范学院 | 师范 |
